服务和费用
MD Anderson PGC设施用户使用说明
服务请求
所有服务请求将通过门户网站在iLab
- 使用MD Anderson证书登录到您的iLab帐户，发起感兴趣的服务请求
- 要申请基因组服务，请点击“请求服务”选项卡
- 要在Illumina iScan上安排成像，请点击“安排设备”标签
- 用户将根据扫描的芯片数量而不是仪器时间来收费
请注意:请用户查看“服务清单”下的基本价格;然而，所有的最终价格取决于设施的批准。
如需客户服务和其他信息，请联系张迪dizhang@mdanderson.org．
生物标本和数据存取
生物标本和/或数据访问(仅供MD Anderson用户使用)需要完成和批准正式申请搬运工
- 获得批准后，请访问“申请服务”提出生物标本申请
如有任何关于REDCap申请流程的问题，请联系张辉huizhang@mdanderson.org
内部，外部网络和UT系统的价格相同
外部网络机构:
- 贝勒医学院
- 莱斯大学
- 休斯顿大学
- 德州农工大学健康科学中心生物科学与技术研究所
PGC FY21价格表
Illumina公司微阵列
PGC微阵列服务提供全方位的高含量(全基因组或靶向)、高通量基因型分析、基因表达和DNA甲基化，以促进人类基因组的分子改变和疾病研究。
PGC微阵列服务管道包括样品质量检查、样品制备、目标杂交、BeadChip成像和使用GenomeStudio进行的数据分析。联系PGC设施，了解更多关于服务类型，样品要求，工作流程，定价和时间表的详细信息。
下面描述的许多阵列都有附加容量，允许半定制设计。
Infinium全球筛选阵列-24
一个经济的下一代全球基因分型阵列，结合多民族全基因组内容，策划临床研究变异和质量控制(QC)标记。乐动体育LDsports中国
55美元/样本
英飞纳姆oncoarray - 500000 BeadChip
能够筛选50万个SNPs与全基因组25万个标签SNPs的骨干。其他SNPs包括乳腺癌、结直肠癌、肺癌、卵巢癌和前列腺癌的遗传变异;血统;定量特征;遗传药理学;以及对常见癌症易感位点的精细定位。
每样77美元
英飞纳姆ImmunoArray-24 BeadChip
检测人类免疫系统中的遗传变异。整合了human immune v1 BeadChip的内容，并补充了gwas识别的自身免疫和炎症疾病位点。
51美元/样本
英飞纳姆Core-24 BeadChip
包含在世界不同人群中发现的全基因组标记snp, indele，外显子聚焦的内容，以及包含多达30万个半定制标记的能力。
每样品59美元
英飞纳姆Exome-24 BeadChip
丰富推定的功能外显子变异，由> 24000个标记组成，来自广泛的人群，包括欧洲、非洲、中国和西班牙血统;常见的人类疾病，如2型糖尿病、癌症、代谢和精神疾病。
每样例57美元
英飞纳姆CoreExome-24 BeadChip
含Infinium Core-24和Exome-24 BeadChip含量。Plus为性别确认、线粒体DNA、祖先、indel和拷贝数变异(CNV)分析提供了额外的常见变异关联覆盖。
每样65美元
Infinium Global Diversity Array-8 BeadChip
使多基因风险评分的发展和特征的遗传结构在不同的群体。建立在高密度单核苷酸多态性(SNP)全球主链上，优化了基因组的跨群体imputation。
每样118美元
英飞纳姆Omni5Exome-4 BeadChip
为全基因组基因分型和拷贝数变异(CNV)研究提供功能性外显子内容。也优化了遗传变异，降低到1%的小等位基因频率(MAF)。
每样335美元
Infinium HD iSelect-24 BeadChip
高清晰度(HD: 3072至90000 BeadTypes)或高吞吐量(HTS: 90001至700,000 BeadTypes)定制设计的BeadChip。支持多达700k自定义目标(SNPs, indels和CNVs)。如需研究设计和咨询，请咨询PGC。
价格要求
其他Illumina公司数组
其他Illumina Infinium基因分型阵列和甲基化阵列(如MethylationEPIC BeadChip)可以在PGC运行。
价格要求
＊对于网络外机构，请登录iLAB查看价格信息，或联系PGC经理。
TaqMan SNP基因分型
TaqMan基因分型分析允许低到中通量的候选基因和通路基因分型研究。预先设计或定制设计的TaqMan探针和靶特异性引物被纳入应用生物系统Vii7或Fluidigm生物标记HD系统上运行的实时PCR检测。TaqMan检测可用于独立验证来自微阵列分析的全基因组识别位点。
启动
- 1000份以下:每SNP 365美元
- 1000个或更多的样品:每SNP 600美元
基因分型
- 少于1000个样本:每SNP样本0.62美元
- 1000 - 2000个样本:每个样本每SNP 0.56美元
- 超过2000个样本:每个样本每SNP 0.45美元
电镀
- 384井格式:每样0.27美元
生物标本申请(MD Anderson调查者专用)
从残留诊断血液(血液标本研究和资源，BSRR)计划和其他资源基因组DNA可用。乐动体育LDsports中国所有申请应通过搬运工在iLab链接。在获得数据和生物标本获取委员会(DBAC)批准后，应通过iLAB发起样品分发请求。
剩余biospecimen DNA
- 样品1-96:每个样品28.00美元
- 样本97及以上*:每个样本$12.50
* 100个样品:96 * $28.00 + 4 * $12.50
额外服务(已确认的PGC项目)
- 研究设计和咨询:75美元/小时
- 自定义DNA提取:每个样本28美元
- DNA再纯化/净化(前96个样本):每个样本22美元
- DNA再纯化/净化(前96个样本):每个样本15美元
- 量子位:$ 5 / /样品
*对于网络外机构，请登录iLAB查看价格信息，或联系PGC经理
Illumina公司iScan
iScan系统是一种高精度、高通量荧光芯片扫描仪，用于从基因分型到DNA甲基化分析的无数Illumina阵列的基因组分析。该系统与一个机器人工作站连接，每天可以扫描数百个阵列样本。
用户可通过PGC iLab在线预约仪器时间。扫描服务是为协助使用只允许(即用户将不允许扫描自己的芯片)。用户不收取仪器使用时间的费用;所有费用将基于扫描芯片的数量。
- Illumina BeadChip使用iScan: 55美元/片