肿瘤内的遗传多样性表明持续演化
大规模基因组分析发现,肿瘤进化是为了适应和生存
MD Anderson新闻发布于2021年4月07日
通过分析来自2600多名患者和38种癌症类型的肿瘤,研究人员乐动体育LDsports中国德克萨斯大学安德森癌症中心以及其他国际机构的成员全基因组联盟的泛癌分析在癌症和个体肿瘤内表征了广泛的遗传多样性。
今天发表的研究细胞发现95%的分析的肿瘤具有至少一种亚克隆,或基因上不同的肿瘤细胞,这些亚克隆通常是非常多样的 - 即使在同一肿瘤中也是如此。研究结果表明,肿瘤继续以帮助癌症生存的方式发展。
肿瘤内的异质性,或肿瘤内细胞的遗传变异,长期以来一直是一个挑战,作为治疗耐药性的机制。肿瘤内不同的亚克隆可能对给定的治疗有不同的反应,导致在治疗后仍然存活的肿瘤细胞亚群重新生长。为了更好地理解这种异质性,联盟的研究人员检查了2658个肿瘤样本的全部基因组。乐动体育LDsports中国
“我们发现每个肿瘤都讲述了自己的演变故事,”高级作者说Wenyi王博士。教授生物信息学和计算生物学.“使用大量样本,我们观察到每个肿瘤都是不同的,但相似的进化模式出现了癌症类型的特征。每种癌症都显示出其亚克隆的独特发展模式。”
知道亚克斯能够在疾病进展过程中形成各种点,研究团队旨在了解哪些激励子币来发展的内容。王说,由于肿瘤发育期间的某些压力,亚克酮可能因某些压力而发展。
支持这一假设,研究人员发现,亚克隆似乎遵循累积变化的进化模式,使乐动体育LDsports中国肿瘤有益,这意味着有益的遗传改变更容易持续存在。
“Cancers are constantly changing over time, so it’s important to recognize that a sample taken from a tumor reflects a single point in time and the cancer will continue to evolve after this,” said corresponding author Peter Van Loo, Ph.D., group leader of the Cancer Genomics Laboratory at the Francis Crick Institute. “They can grow into a patchwork with sections driven by different mutations and evolutionary pressures. Understanding more about the evolution of subclones, why they develop in one direction over another, as well as how common they are, could help doctors better predict the levels of and types of variation likely to be present in a specific cancer type.”
对肿瘤内异质性的更大了解将有助于医生和研究人员对每位患者的最佳治疗计划做出更明智的决定,因为它们将更好地预测患者的反复响应和变复发的可能性。乐动体育LDsports中国
“利用来自肿瘤组织标本的高通量测序数据,理解癌症亚克隆随时间的发展及其后果的分析挑战是巨大的,”王说。“在这项研究中,经过统计学家、计算机科学家和计算生物学家多年的团队合作,我们终于能够初步描述这些亚克隆。我们希望世界各地乐动体育LDsports中国的研究人员在设计自己的癌症进化假说和研究时可以利用这一资源。”
作为这项研究的结果,该联盟创建了一个开放乐动体育LDsports中国获取的资源,包括在肿瘤样本中识别出的遗传变异的策划摘要,并为任何想要进行癌症基因组分析的研究人员共享其计算方法。Wang指出,在未来,可能会对转移性肿瘤进行类似的分析,以了解这些样本的异质性。
MD Anderson研乐动体育LDsports中国究人员现在正在使用这些调查结果,以便与MD Anderson的合作进行持续的努力和设计新项目Moon Shots®以及其他研究人员,他们专注于直肠癌、甲状腺癌、膀胱癌、前列腺癌和卵巢癌。
除王某和梵新除了这项研究的高级作者还包括Quaid D. Morris,博士,多伦多大学,加拿大,加拿大,纽约市纪念斯洛南凯瑟林癌症中心;而David C. Wedge,Ph.D.,牛津大学,英国牛津,代表全基因组联盟的泛癌分析。可以找到提交人的完整列表及其披露这里.
