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      前
      文义王形象

      文义王,博士。

      生物信息学与计算生物学系,基础科学划分

      关于王博士

      王文义教授是一位大数据科学家,拥有统计学和生物学的学术背景。她的主要兴趣在于利用数据争论来理解癌症多组学产生的大数据。她的实验室的统计方法和工具开发是数据驱动的,并以解决重要和新颖的生物学问题为动力。

      她的实验网站是:https://din.mdacc.tmc.edu/~ wwang7/.

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      目前职务及所属单位

      主要约会

      德克萨斯大学安德森癌症中心定量科学部生物信息学和计算生物学系教授

      双/共同/兼职的约会

      德克萨斯大学安德森癌症中心生物统计学系定量科学部教授

      德州农工大学统计学系教授

      乐动体育LDsports中国研究兴趣

      实验室目前的主要研究重点是:乐动体育LDsports中国

      1)利用转录组和基因组数据(基因组间数据)的计算反褶积,从大样本和单细胞测序数据获得肿瘤异质性和进化。我们的目标是了解a)肿瘤微环境可能导致预后或治疗反应的不同结果,b)正常组织中细胞-细胞相互作用的分子机制。

      2)个性化癌症风险预测模型,使用TP53突变相关的Li-Fraumeni综合征作为疾病模型;和新颖的统计建模和研究设计,以进一步了解TP53突变的泛癌影响。

      该实验室根据需要使用统计/计算工具箱,包括深度学习方法。我们目前的重点是高维数据中的混合建模和机器学习。

      教育和培训

      授予教育

      2007年 约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院,美国巴尔的摩医学博士,生物统计学博士
      2003年 哥伦比亚大学医师和外科医生,纽约,纽约,美国,马,人类营养
      2001年 复旦大学生物学学士

      体验和服务

      行政任命/职责

      招生委员会成员,gbs,休斯顿,德克萨斯州,2018 - 2020

      定量科学计划联合主任,德克萨斯大学休斯顿,休斯顿,TX,2014 - 2018年生物医学科学研究生院

      其他的约会/责任

      大学成员,贝勒医学院定量计算生物学研究生课程,休斯顿,TX,2017 - 至今

      选定的出版物

      同行评议的文章

      1. 高F,Pan X,Dodd-Eaton EB,Reco CV,Montierth MD,Bojadzieva J,Mai Pl,Zelley K,Johnson Ve,Braun D,Nichols Ke,Garber Je,Savage SA,强大的LC,Wang W.基于谱系的预测模型鉴定了锂呋喃氏综合征的家庭中有害De Novo突变的载体。Genome Res 30(8):1170-1180,2020。E-PUB 2020. PMID:32817165。
      2. Shin Sj,Li J,Ning J,Bojadzieva J,强大LC,王W.半参数复发事件模型的贝叶斯估计及其在Li-Fraumeni综合征多原发癌外显率估计中的应用生物统计学21(3):467 - 482年,2020年。e-Pub 2018。PMID: 30445420。
      3. 王伟,王伟.利用逆矩先验对生存数据进行贝叶斯变量选择。北京大学学报(自然科学版),2019,37(2):417 - 418。e-Pub 2020。PMID: 33456641。
      4. McCarthy DJ,Rostom R,Huang Y,Kunz DJ,DaneCek P,Bonder MJ,Hagai T,Lyu R,Hipsci Consortium,W​​ang W,Gaffney DJ,Simons Bd,Stegle O,Teichmann SA.Cardelino:体细胞克隆子结构和单细胞转录om的计算集成。NAT方法17(4):414-421,2020。E-PUB 2020. PMID:32203388。
      5. Gerstung M,Jolly C,Leshchiner I,Dentro SC,Gonzalez S,Rosebrock D,Mitchell TJ,Rubanova Y,Anur P,Yu K,Tarabichi M,Deshwar A,Wintersinger J,Kleinheinz K,Vázquez-Garcíai,Haase K,Jerman L,Sengupta S,Macintyre G,Malikic S,Donmez N,Livitz DG,CMero M,Demeulemeester J,Schumacher S,Fan Y,Yao X,Lee J,Schlesner M,Boutros PC,Bowtell DD,Zhu,Getz G,Imielinski M,Beroukhim R,Sahinalp Sc,Ji Y,Peifer M,Markowetz F,Mustonen V,Yuan K,Wang W,Morris QD,PCAWG演进&异质性工作组,Spellman Pt,Wedge DC,Van Lo P,PCAWG联盟.进化史2,658名癌症。自然578(7793):122-128,2020。E-PUB 2020. PMID:32025013。
      6. 吴CC,Beird HC,Andrew Livingston J,Advani S,Mitra A,Cao S,Reuben A,Ingram D,Wang Wl,Ju Z,Hong Leung C,Lin H,Zheng Y,Roszik J,Wang W,Patel S,Benjamin Rs,Somaiah N,Conley AP,Mills GB,HWU P,Gorlick R,Lazar A,Daw NC,Lewis V,Futreal PA.骨肉瘤的免疫基因组景观。NAT Comment 11(1):1008,2020。E-PUB 2020. PMID:32081846。
      7. Shin SJ, dod - eaton EB, Gao F, Bojadzieva J, Chen J, Kong X, Amos CI, Ning J, Strong LC, Wang W.随着时间的推移估算李 - 弗拉梅尼综合征的家族中的第一和第二原发性癌症诊断:单一机构的观点。Cancer Res 80(2):347-353,2020。E-PUB 2019. PMID:31719099。
      8. Shin Sj,Dodd-eaton EB,Peng G,Bojadzieva J,Chen J,Amos CI,Brone Mn,Khincha PP,Mai Pl,Savage SA,Blashinger ML,Thomas DM,Yuan Y,强大的LC,Wang W.Li-Fraumeni综合征家族不同癌症类型的外显率:一项多中心队列验证研究。中国生物医学工程学报,2017,32(2):362 - 368。e-Pub 2019。PMID: 31719101。
      9. Haider S,Tyekucheva S,Prandi D,Fox NS,Ahn J,Xu Aw,Pantazi A,Park PJ,Laird PW,Sander C,Wang W,Demichelis F,Loda M,Boutros PC,癌症基因组Atlas研究网络乐动体育LDsports中国.肿瘤纯度的系统评价及其临床意义。JCO Precis Oncol 4, 2020。e-Pub 2020。PMID: 33015524。
      10. Maura F, Agnelli L, Leongamornlert, Bolli N, Chan WC, Dodero A, Carniti C, Heavican TB, Pellegrinelli A, Pruneri G, Butler A, Bhosle SG, Chiappella A, Di Rocco A, Zinzani PL, Zaja F, Piva R, Inghirami G, Wang W, Palomero T, Iqbal J, Neri A, Campbell PJ, Corradini P.转录和突变数据的整合简化了外周t细胞淋巴瘤的分层。美国临床医学杂志(Am J Hematol 94, 6):628-634, 2019。e-Pub 2019。PMID: 30829413。
      11. Tarabichi M,Martungen I,Gersung M,Leroi Am,Markowetz F,PCAWG演进和异质性工作组,Spellman Pt,Morris QD,LingjærdeOC,Wedge DC,Van Loo P..中性肿瘤进化?Nat Genet 50(12):1630-1633,2018。E-PUB 2018. PMID:30374075。
      12. Wang Z, Morris JS, Cao S, Ahn J, Liu R, Tyekucheva S, Li B, Lu W, Tang X, Wistuba II, Bowden M, Mucci L, Loda M, Parmigiani G, Holmes CC,王W..具有免疫浸润的异质性肿瘤样本的转录组反褶积iScience, 2018年。e-Pub 2018。
      13. Shin Sj,Yuan Y *,强大的LC,Bojadzieva J,王W.*.贝叶斯半甲酰均估计癌症特异性年龄 - 发病术治疗锂呋喃烯综合征。Jasa,2018. E-PUB 2018。
      14. 李军,傅超,速度TP,王W *,symmans f *.从福尔马林固定的癌症组织中精确RNA测序,从冷冻组织代表高质量的转录组。临床肿瘤精密肿瘤学杂志,2018。E-PUB 2018. PMID:29862382。
      15. PENG G,Bojadzieva J,Ballinger Ml,Li J,Blackford Al,Mai Pl,Savage SA,Thomas DM,强大的LC,Wang W.使用LFSPRO估计Li-Fraumeni综合征家族中TP53突变携带者的概率。癌症流行病学与生物标志物预测26(6):837-844,2017。e-Pub 2017。PMID: 28137790。
      16. 刘锐,王智,王伟,安杰,Asselin-Labat ML, Smyth GK, Ritchie ME.RNA-seq调酒:设计真实的对照实验,比较方案和分析方法。中国生物医学工程学报,2017,35(5):514 - 514。e-Pub 2016。PMID: 27899618。
      17. MI, Shen P, Odegaard JI, Fung E, Chiang T, Peng G, Davis RW,王W.,kharrazi m,schrijver i,scharfe c.新生儿干燥血液的下一代分子检测囊性纤维化。J Mol Diage 18(2):267-82,2016。E-Pub 2016. PMID:26847993。
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      书章节

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      标题: TP53中系列种系突变癌症风险预测的统计方法和工具
      资金来源: NIH / NCI.
      角色: 主要调查员
      标题: 神经视网膜的细胞图谱
      资金来源: Chan Zuckerberg倡议通过Subaward Bayly医学院
      角色: 共同主体调查员
      标题: 改进Li-Fraumeni综合征的风险预测:临床卫生保健提供者的实用工具
      资金来源: 德州癌症预防与研究所乐动体育LDsports中国
      角色: 共同主体调查员
      标题: 未分化甲状腺癌的肿瘤内异质性:对新辅助BRAF和免疫定向治疗反应的影响
      资金来源: 标志基金会
      角色: 共同主体调查员
      标题: 原发性和转移性结直肠癌亚克隆扩增和免疫环境特征的整合基因组分析
      资金来源: MD Anderson SPORE胃肠道癌症发展研究项目奖乐动体育LDsports中国
      角色: 主要调查员

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