对基因增强子的研究揭示了一些癌症的形成和扩散方式
对33种癌症类型的近9000个肿瘤样本的研究发现，增强子是治疗靶点的关键调控因子，包括PD-L1
MD安德森新闻稿2018年4月5日
任何癌症诊断或治疗的核心都是细胞。如果把控制基因激活的细胞成分看作是基因调控层的俄罗斯套娃，那么在这些越来越小的层中就有被称为增强子的非编码DNA短片段。一项研究德克萨斯大学安德森癌症中心揭示增强剂作为诊断和/或治疗许多癌症的一个重要的研究领域。乐动体育LDsports中国
癌症研究人员对乐动体育LDsports中国增强子很感兴趣，因为它们可以关闭或打开基因。成千上万的增强剂可以存在于单个细胞中，但是研究人员一直没有深入了解它们是如何工作的。这项研究的发现为这些细胞成分提供了重要的新知识，发表在2018年4月5日的网络版细胞．
“尽管增强子在癌症发展中的作用已经被越来越多的人认识到，但关于增强子活性的全基因组研究还没有在大的患者队列中进行，”他说汉梁博士。的研究负责人和副教授生物信息学与计算生物学在德克萨斯大学安德森癌症中心。“我们的研究首次能够说明增强因子表达在广泛癌症中的‘景观’。”
在癌细胞中，调节网络经常被“重新连接”，从而导致癌症;然而，人们对这是如何发生的了解有限。Liang的团队发现增强子是这一谜题中缺失的一块，表明在几个关键发现中，它们作为治疗靶点的关键调控因子，包括程序性死亡配体-1 (PD-L1)。
PD-L1是一种抑制免疫系统、允许癌症形成和生长的蛋白质，是许多现有和新兴免疫疗法的重要靶点。利用rna测序数据癌症基因组图谱(TCGA)， Liang的团队对33种癌症类型的8928个肿瘤样本进行了全基因组分析，并确定了除PD-L1外的相当数量的增强子。
该研究是胰腺癌图谱的一部分，该图谱旨在通过癌症基因组图谱(TCGA)检查所有可获得的肿瘤，以回答有关癌症的重要问题。TCGA是美国国家癌症研究所(NCI)和美国国家人类基因组研究所(NHGRI)的联合努力。乐动体育LDsports中国这项研究是完成PanCancer Atlas和TCGA任务的几项研究之一，该任务绘制了一系列癌症类型的关键基因组变化，并提供了一个社区资源，加速我们对癌症分子基础的理解。
Liang说:“我们的研究为多种肿瘤中增强活性提供了一个系统的观点，提出了一个概念性的新策略来抑制关键的治疗靶点。”
该团队还通过检测一种靶向脾酪氨酸激酶(SYK)的增强子，证明了增强子是如何作为生物标记物的，这种增强子通常与多种晚期癌症有关。在观察患者生存时间时，增强剂被证明是几种癌症预后不良的标志。
基于TCGA分析，Liang的团队还提出了一个模型，其中染色质——DNA的“包装”——可能是某些增强子激活过程的关键因素，这为基因突变和克隆如何演变成某些癌症提供了见解。
Liang说:“如果一个单一的肿瘤祖细胞的染色质组织发生变化，那么这种变化可能会导致不同肿瘤之间的显著差异。”“染色质组织可能会被癌症中常见的组蛋白基因突变大幅重塑。”
该团队对增强子在整个癌症基因组中既“开启”又“关闭”的独特能力的观察，提供了关于肿瘤克隆进化(癌症形成的循序渐进的细胞过程)的新数据，并揭示了一些与癌症相关的基因相关的增强子。梁补充说，还需要进一步研究增强剂在临床应用中的潜力。
MD Anderson研究团队成员包括博士陈晗;春燕Li博士;鑫鑫彭博士;周至诚博士;约翰·温斯坦，医学博士，博士，生物信息和计算生物学系的所有人。这项研究是TCGA计划的一部分，该计划是美国国家癌症研究所和美国国家人类基因组研究所共同努力的结果。乐动体育LDsports中国
该基金来自美国国立卫生研究院(CA175486, CA209851和CA016672)和德克萨斯州癌症预防和研究所(RP140462)。乐动体育LDsports中国