新型基因狩猎方法介绍了胰腺癌的新罪魁祸首

乐动体育LDsports中国研究人员开发快速筛选技术;寻找基因捍卫DNA损伤的肿瘤

通过更迅速分析移植到小鼠的人类肿瘤,使用创新方法识别癌症的遗传脆弱性,研究人员已经确定了胰腺癌治疗的新潜在目标,发表乐动体育LDsports中国在线的在细胞报告中。

该团队由科学家们在德克萨斯州MD安德森癌症中心大学领导,发现基因WDR5保护来自DNA损伤的胰腺肿瘤,与先前已知的癌症促进基因一起使用,称为Myc,以帮助肿瘤茁壮成长。

“WDR5-MYC连接对于胰腺癌细胞增殖至关重要,”研究CO-First Allessandro Carugo,Ph.D.,MD Anderson的研究所研究科学家乐动体育LDsports中国应用癌症科学研究所(IACS)。

他们的发现是目前在MD Anderson的技术的演示项目共同临床试验中心评估人类癌症更现实,生活模型中的基因功能。

“这项新技术使我们能够更快地识别维持肿瘤的遗传驱动因素,从而潜在地找到对待它的新方法,”IACS和教授的主任博士德拉特塔说,M.D.。基因组医学分子和细胞肿瘤学

功能遗传筛查可以在实验室中的癌细胞系中进行,Carugo注意,但细胞系不代表实际肿瘤的挑战基因组复杂性。

乐动体育LDsports中国研究人员一直服用患者的肿瘤,手术从患者移植,将它们移植在小鼠中,并使用它们发现新的途径用于治疗可比较的人类肿瘤。

Carugo表示,这些称为患者衍生的异种移植物(PDX)的小鼠中的这些人类肿瘤并未受到大规模的功能遗传筛查。“这里真的不同的是,我们正在申请患者衍生的异种移植物的功能筛查。”

飞行员提供更快的筛选

该团队的方法被称为患者基于体内杀伤性以优化治疗(飞行员)。它允许仅使用少数小鼠分析数百只肿瘤基因。

试点技术正在掌握在MD安德森的月亮射击计划旨在通过基于科学发现的新处理,早期检测方法和预防计划更快地减少癌症死亡。该技术用于分析胰腺,肺,结直肠头和颈部癌症的PDX。CCCT和IACS是月亮镜头计划的平台。

通常,研究人员服用PD乐动体育LDsports中国X,将组织扩展,在30或以上的小鼠中移植,然后在每只小鼠的肿瘤中测试一种药物化合物。

“通过飞行员,在许多小鼠的时间一次将样品扩大以将不同的药物挑战它,我们将更多的测试应用于一些小鼠来识别基因组司机,”Carugo说。

一步一步找到新的目标

研究人员乐动体育LDsports中国采用患者的主要肿瘤样本,并测试其在小鼠中有效植入的能力。他们这样做,Carugo通过将慢病毒递送的分子“条形码”的跟踪文库应用于样品来评估肿瘤引发细胞的频率。

“这让我们在逐案的基础上快速读出植入效果,”Carugo说。替代方案是用不同数量的肿瘤细胞感染许多小鼠,以找到导致肿瘤发展的最小数量 - 更繁琐的过程。

封存效率结果指导下一步,施用短发夹RNA,已知关闭特定基因,对样品。分析肿瘤中的SHRNA的耗尽意味着特定基因。

然后将来自人肿瘤的细胞在小鼠中嵌入,一旦肿瘤发育,就在样品中建立的剂量上施加ShRNA文库。

该团队选择了一个ShRNA库,其与参与表观遗传过程的基因,特别是调节染色质的基因 - 组成染色体的基因和组蛋白的混合。染色质调节会影响基因转录和活化。

染色质调节因子的遗传病变已在许多癌症中鉴定,研究人员说明是胰腺癌的标志。乐动体育LDsports中国

他们应用了ShRNA库,检测到耗尽的SHRNA的前15%至30%,然后使用多种方法来评估它们的“命中”。

WDR5出现了强大的“击中”

WD重复的蛋白5(WDR5),指南针复合调节染色质功能的核心部分,涉及多个屏幕。其他人最近的研乐动体育LDsports中国究表明,在前列腺和膀胱癌症中均上调,对癌细胞增殖至关重要。

与正常的胰腺组织相比,该团队证实WDR5在胰腺癌中高度表达,然后进行了一系列实验,该实验显示了爆震基因受损细胞增殖和肿瘤生长,小鼠的存活率大大增加。

随后的实验表明WDR5与Myc一起使用Myc来保护胰腺癌免受DNA损伤。Carugo说,没有已知的方法来分开定位WDR5或MYC,但团队认为可能有办法阻止他们的互动。

虽然团队有针对性的表观遗传调节因子,但Carugo注意到该技术可与其他针对不同类别类别的ShRNA文库一起使用。

MD Anderson的月球射击团队正在广泛采用这项技术,以识别各种疾病亚型特异性的遗传脆弱性和癌症目标。

与Carugo和Draetta的共同作者包括联合作者Giannicola Genovese,M.D.,基因组医学,以及应用癌症科学研究所的Sahil Seth。Other MD Anderson co-authors are Luigi Nezi, Ph.D., Johnathon Rose, Andrea Viale, M.D., Piergiorgio Pettazzoni, Ph.D., Kadir Akdemir, Ph.D., Frederick Robinson, James Tepper, Nora Sanchez, Ph.D., Wantong Yao, Ph.D., Maria Emilia Di Francesco, Ph.D., Tessa Green, Denise Corti, Ph.D., and Lynda Chin, M.D., all of Genomic Medicine; Parantu Shah, Ph.D., Christopher Bristow, Ph.D., Virginia Giuliani, Ph.D., and Philip Jones, Ph.D., all of IACS; Sonal Gupta, Ph.D., and Anirban Maitra, M.B.B.S., of the Sheikh Ahmed Bin Zayed Al Nahyan Center for Pancreatic Cancer Research; Ya’an Kang, M.D., Ph.D., and Jason Fleming, M.D., of Surgical Oncology, Marcos Estecio, Ph.D., of Epigenetics and Molecular Carcinogenesis; Huamin Wang, M.D., Ph.D., of Pathology and Ronald DePinho, M.D., of Cancer Biology; Daniela Bossi, Ph.D., Angelo Cicalese, Ph.D., Gaetano Dellino, Ph.D., Carolina D’Alesio, Pier Pelicci, M.D., Ph.D., and Luisa Lanfrancone, Ph.D., of Experimental Oncology, European Institute of Oncology, Milan, Italy; Laura Riva, Ph.D., of the Center for Genomic Science of Istituto Italiano di Tecnologia, Milan; and Timothy Heffernan, Ph.D., C-4 Therapeutics, Cambridge, MA.

乐动体育LDsports中国研究由美国癌症研究协会的补助金提供资金,Sheikh Ahmed Bin Zayed Al Nahyan胰腺癌中心和意大利癌症研究基础。