癌症基因组图谱的泛癌症蛋白质组学透视

基于无监督聚类的RBN泛癌数据集热图（图2a的交互式高分辨率热图）

链接-图2a

基于无监督聚类的MC泛癌数据集热图（图3a的交互式高分辨率热图）

链接-图3A

基于路径得分的RBN泛癌数据集热图（图4c-f和补充图6和8的交互式高分辨率热图）

凋亡评分

链接-由集群和分数管理

链接-由肿瘤谱系和评分监督

细胞周期评分

链接-由集群和分数管理

链接-由肿瘤谱系和评分监督

DNA损伤反应评分

链接-由集群和分数管理

链接-由肿瘤谱系和评分监督

EMT评分

链接-由集群和分数管理

链接-由肿瘤谱系和评分监督

你有分数吗

链接-由集群和分数管理

链接-由肿瘤谱系和评分监督

激素b评分

链接-由集群和分数管理

链接-由肿瘤谱系和评分监督

PI3K/Akt评分

链接-由集群和分数管理

链接-由肿瘤谱系和评分监督

Ras/MAPK评分

链接-由集群和分数管理

链接-由肿瘤谱系和评分监督

RTK分数

链接-由集群和分数管理

链接-由肿瘤谱系和评分监督

TSC/mTOR分数

链接-由集群和分数管理

链接-由肿瘤谱系和评分监督

基于RBN泛癌症数据集的路径得分点图（补充图7和9）

RBN集群的路径得分

补充图7.pdf

肿瘤谱系的通路评分

补充图9.pdf

基于RBN泛癌数据集的可作用蛋白质热图（图5的交互式高分辨率热图）

链接-由集群和分数管理

链接-由肿瘤谱系和评分监督

无偏数据驱动信令网络（图6的高分辨率）

匹配（cis）相关性和褶皱变化分析

匹配（顺式）蛋白：mRNA相关性分析（补充数据1的完整结果）

因病

补充数据1顺式mRNA（BLCA）.csv

补充数据1顺式mRNA（BRCA）.csv

补充数据1顺式mRNA（COAD）.csv

补充数据1顺式mRNA（GBM）.csv

补充数据1顺式mRNA（HNSC）.csv

补充数据1顺式mRNA（KIRC）.csv

补充数据1顺式mRNA（LUAD）.csv

补充数据1顺式mRNA（LUSC）.csv

补充数据1顺式mRNA（OVCA）.csv

补充数据1顺式mRNA（泛癌）.csv

供应数据1顺式mRNA（读取）.csv

提供数据1顺式mRNA（UCEC）.csv

匹配（顺式）蛋白质：CNV折叠变化分析（补充数据5的完整结果）

提供数据5 cis CNV.csv

匹配（顺式）蛋白质：突变倍数变化分析（补充数据7的完整结果）

提供数据\u 7\u cis\u Mut.csv

互相关与褶皱变化分析

蛋白质：mRNA（反式）相关分析（使用补充数据2的Spearmanρ>0.3或ρ<-0.3过滤完整结果）

supplu_Data_2_trans_mRNA.csv

蛋白质：miRNA（反式）相关分析（补充数据3的完整结果）

提供数据\u 3\u trans\u miRNA.csv

蛋白质：蛋白质（反式）相关分析（补充数据4的完整结果）

Supplu_Data_4_trans_protein.csv

蛋白质：CNV（反式）折叠变化分析（使用折叠变化过滤完整结果≤0.8或≥1.2补充数据（第6部分）

提供数据6传输CNV和csv

提供数据6传输CNV del.csv

蛋白质：突变（反式）折叠变化分析（使用adj.P<0.05筛选完整结果，突变病例>补充数据8的1%）

提供数据传输8.csv

鉴别器分析（补充表2-5和9-12的完整结果）

补充表格蛋白质鉴别器RBN.xls

提供表格\u 3\u RNA\u鉴别器\u RBN.xls

提供表格4 miRNA鉴别器RBN.xls

补充表格5变异鉴别器RBN.xls

补充表9蛋白质鉴别器MC.xls

提供表格10 RNA鉴别器MC.xls

提供表格11微RNA鉴别器MC.xls

补充表格12变异鉴别器MC.xls

网络中蛋白质-蛋白质链绝对偏相关的可视化（高分辨率图补充图13）

补充图13.pdf