遇见尼古拉斯纳文，博士。
尼古拉斯纳文，博士。
基础科学划分遗传学系
关于纳文博士
他是MD安德森癌症中心(MD Anderson Cancer Center)的副教授，在生物信息学部门担任联合职务。他是The University of Texas MD Anderson Cancer Center UTHealth Graduate School of Biomedical Sciences的教员。他还是CPRIT单细胞基因组中心(Single Core)的主任，MD Anderson的先进技术基因组中心(ATGC)的联合主任。
他在Michael Wigler博士的指导下在冷泉港实验室进行了研究生和博士后培训。在此期间，他发明了第一种用于哺乳动物细胞基因组测序的单细胞DNA测序方法(single - nucleus - sequencing) (Navin et al. 2011, Nature.)。这项工作在建立单细胞基因组学领域中发挥了关键作用。Navin实验室继续处于单细胞癌症基因组学领域的前沿，他们在三阴性乳腺癌中发现了复制数进化的标点模型(Gao et al. 2016，并阐明了突变体表型和亚克隆突变在乳腺癌进化中的作用(Wang et al. 2014, Nature)。
除了用于分析所得的大规模数据集的创新计算和统计方法之外，纳文纳的小组博士继续开发用于进行单细胞DNA和RNA测序的开发新技术。这些方法正在侵袭，转移和治疗抵抗的背景下研究癌症演变。他的实验室与MD Anderson的领先肿瘤学家和病理学家密切合作，将这些技术转化为诊所，他们准备在降低人类患者的发病率产生重大影响。
Dr. Navin has been the recipient of many prestigious awards in recognition of his work, including the Damon-Runyon Innovator Award, AAAS Wachtel Award, ACS Research Scholar Award, Wilson Stone Award, the Randall Innovator Award and the MD Anderson President’s Award for Research Excellence.
访问纳文博士实验室的网站．查看的完整列表纳文博士的出版物．纳文博士,谷歌学术
目前职务及所属单位
主要约会
德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州安德森大学基础科学研究科学研究部副教授乐动体育LDsports中国
Cprit Currit Single Cell Genomics Center，德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州和德克萨斯群岛癌症中心基础科学研究系遗传学系乐动体育LDsports中国
德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州安德森癌症中心基础科学研究部的遗传学系先进技术基因组学核心核心核心先进科学研究系乐动体育LDsports中国
双/共同/兼职的约会
德克萨斯大学安德森癌症中心生物信息学和计算生物学副教授
德克萨斯大学安德森癌症中心生物医学科学研究生院副教授
乐动体育LDsports中国研究兴趣
单细胞基因组学;癌症演变;液体活检基因组学;计算生物学
我们的团队率先开发了单细胞基因组测序技术，我们应用该技术来理解人类癌症的复杂生物学过程，包括肿瘤的起始、侵袭、转移和治疗耐药性。我们把癌症作为一个进化过程来研究，在这个过程中，克隆体在选择压力下进行选择和扩展。我们认为肿瘤是一个复杂的生态系统，它是由肿瘤细胞和基质细胞类型之间复杂的相互作用维持的。我们的使命是获得癌症进化的新知识，可以用来提高生活质量和降低癌症患者的发病率。在MD安德森，我们在将基因组技术应用于临床方面处于独特的地位，这些技术将对癌症患者的早期检测、诊断和治疗策略产生重大影响。
教育和培训
授予教育
| 2010 | 冷泉港实验室和石溪大学，冷泉港，纽约，美国，博士，分子遗传学 |
| 2003 | Skidmore College，Saratoga Springs，NY，美国，BS，细胞生物学 |
研究生培训
| 2010-2011 | 博士后研究员，癌症遗传学，冷泉港实验室，冷泉港，纽约 |
体验和服务
学术任命
德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州安德森大学，休斯顿，TX，2011年，德克萨斯州MD癌症中心大学助理教授
2011 - 2016年，德克萨斯大学安德森癌症中心遗传学基础科学研究部门助理教授乐动体育LDsports中国
助理教授，德克萨斯大学MD安德森癌症中心UTHealth生物医学科学研究生院，休斯顿，德克萨斯州，2011 - 2016
荣誉与奖励
| 2019 | 德克萨斯大学安德森癌症中心总统卓越研究奖乐动体育LDsports中国 |
| 2019 | BlavaTnik颁发生命科学，国家入围者 |
| 2018 | 德克萨斯大学教师奖，德克萨斯大学M.D.安德森癌症中心 |
| 2018 | 达拉斯/沃斯堡活着的传奇教师成就奖在基础研究，德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心乐动体育LDsports中国 |
| 2017 | Jack和Beverly Randall卓越奖癌症治疗，兰德尔家族基金会 |
| 2017 | 挑战奖，前列腺癌基础 |
| 2017 | 斯托尼布鲁克大学40岁以下青年奖学金 |
| 2016 | 总统德克萨斯大学德克萨斯大学安德森癌症中心学者奖 |
| 2016 | 萨宾奖学金，安德鲁·萨宾家庭基金会 |
| 2016 | ACS研乐动体育LDsports中国究学者，美国癌症协会（ACS） |
| 2016 | 总统德克萨斯大学教育卓越的认可，德克萨斯州大学。安德森癌症中心 |
| 2016 | 德克萨斯大学安德森癌症中心教授学者奖 |
| 2015 | 美国科学促进会马丁·罗斯·瓦赫特尔奖 |
| 2014 | 德克萨斯大学教师奖，德克萨斯大学M.D.安德森癌症中心 |
| 2013 | T.C.香港奖，青年调查员奖 |
| 2013 | 威尔逊S. Stone Memorial奖 |
| 2013 | 达蒙-鲁尼恩创新者奖，达蒙-鲁尼恩·拉克莱夫基金会 |
| 2010 | 年轻的调查员奖，基因组技术杂志 |
| 2009 | T32 NCI奖学金，国家癌症研究所 |
| 2009 | 亚伯拉罕奖，石溪大学 |
| 2008 | 石溪大学金和米勒奖学金 |
| 2005 | Lindsey-Goldberg奖学金，冷泉港实验室 |
选定的出版物
同行评议的文章
- Davis A, Gao R, Navin N．SCOPIT：单细胞测序实验的样本大小计算。BMC BioInformatics 20（1）：566,2019。PMID：31718533。
- Zafar H, Navin N, Chen K, Nakhleh L．SICLONEFIT：来自单细胞基因组测序数据的肿瘤克隆人口结构，基因型和文学的贝叶斯推断。Genome Res（11）：1847-1859,2019。PMID：31628257。
- 王F，梁某，Kumar T，Navin N，Chen K.．SCMarker：用于单细胞转录组分析的AB Initio标记选择。PLOS计算BIOL 15（10）：E1007445,2019。PMID：31658262。
- 玉米pg，heath ei，zurita a，ramesh n，xiao l，sei e，li-ning-tapia e，tu sm，sumudhi sk，王x，王x，efstathiou e，thompson tc，troncoso p，navin n，logothetisCJ，Aparicio Am．卡巴他赛联合卡铂治疗转移性去雄耐药前列腺癌:一项随机、开放标签、1-2期试验Lancet Oncol 20(10):1432-1443, 2019。PMID: 31515154。
- 张Y，熊，刘B，裤子V，Celii F，Chau G，Elizondo-Fraire Ac，Yang P，You MJ，El-Naggar Ak，Navin Ne，Lozano G．体细胞TRP53突变差异驱动乳腺癌和转移的演化。NAT Commun 9（1）：3953,2018。E-PUB 2018. PMID：30262850。
- Kim C＆Gao R，Sei E，Brandt R，Hartman J，Hatshek T，Crosetto N，Foukakis T和Navin N.．用单细胞测序描述三阴性乳腺癌的耐药进化。细胞173(4):879 - 893年,2018年。PMID: 29681456。
- Casasent AK, Schalck A, Gao R, Sei E, Long A, Pangburn W, Casasent T, Meric-Bernstam F, Edgerton ME, Navin NE．地形单细胞测序鉴定的乳腺肿瘤中的多链条侵袭。细胞172（1-2）：205-217,2018。PMID：29307488。
- 梁曼丽，Davis A, Gao R, Casasent A, Wang Y, Sei E, Vilar E, Maru D, Kopetz, Navin, N．单细胞DNA测序揭示了转移性结直肠癌的晚期传播模型。中国生物医学工程学报，2017,37(8):1287-1299。PMID: 28546418。
- 高河，戴维斯A，麦当劳，SEI E，Shi X，王Y，Tsai PC，赌场A，水域J，Zhang H，Meric-Bernstam F，Michor F，Navin Ne．三重阴性乳腺癌的标点拷贝数演化与克隆瘀滞。NAT Genet 48（10）：2016年1119-30. E-PUB 2016. PMID：27526321。
- Mann KM, Newberg JY, Black MA, Jones DJ, Amaya-Manzanares F, Guzman-Rojas L, Kodama T, Ward JM, Rust AG, van der Weyden L, Yew CC, Waters JL, Leung ML, Rogers K, Rogers SM, McNoe LA, Selvanesan L, Navin N, Jenkins NA, Copeland NG, Mann MB．利用SBCapSeq分析单个髓系白血病细胞的肿瘤异质性和驱动基因。自然生物技术34(9):962- 72,2016。PMID: 27479497。
- Zafar H，Wang Y，Nakhlem L，Navin N，Chen K.．单核：单细胞中的单核苷酸变体检测。自然方法，2016. PMID：27088313。
- 梁曼丽，王勇，金灿，高锐，姜杰，世娥，纳文东北．从单一核的高度复用靶向DNA测序。NAT PROTOC 11（2）：214-35,2016。E-PUB 2016. PMID：26741407。
- 梁m，王y，waters j，navin n．SNES:单核外显子组测序。中国生物医学工程学报25(16):55,2015。PMID: 25853327。
- Molhatra A, Wang Y, Waters J, Hall I, Navin N．Ploidy-Seq:通过测序多倍体肿瘤亚群推断突变年表。基因组医学7(1):6,2015。PMID: 25729435。
- 王Y，Waters J，unruh A，RoH W，Shi X，Chen K，Scheet P，Vattathil S，Liang H，Multani A，Zhang H，Zhao R，Michor F，Meric-Bernstam F，Navin Ne。．单核基因组测序揭示乳腺癌的克隆演变。自然512（7513）：2014年155-60,2014. PMID：25079324。
- Baslan T，Kendall J，Troge J，Stepansky A，Wigler M，Navin N，Hicks J.．单细胞的基因组拷贝数分析。自然协议7（6）：1024-41,2012。PMID：22555242。
- Navin N，Kendall J，Troge J，Rodgers L，Cook K，Stepansky A，Levy D，Lee Y，Esposito D，Muthuswamy L，Hicks J，Wigler M．通过单细胞测序推断肿瘤的进化。自然7(472):90 - 2011。PMID: 21399628。
- Malihi PD, Graf RP, Rodriguez A, Ramesh N, Lee J, Sutton R, Jiles R, Ruiz Velasco C, Sei E, Kolatkar A, Logothetis C, Navin NE, Corn P, Aparicio AM, Dittamore R, Hicks J, Kuhn P, Zurita AJ．单细胞循环肿瘤细胞分析显示出基因组不稳定性作为侵袭性前列腺癌的独特特征。临床癌症Res。E-PUB 2020. PMID：32341031。
邀请的文章
- 王y，navin n．单细胞测序技术的进展与应用。中国生物医学工程学报，2017,30(4):598-609。PMID: 26000845。
补助金支持
| 标题: | 用单细胞测序研究TNBC乳腺癌患者的化疗耐药进化 |
| 资金来源: | 莱夫科夫斯基基础 |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 研究TNBC的突变进化和肿瘤内异质性 |
| 资金来源: | 美国癌症协会（ACS） |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 集成单细胞基因组学核心设施 |
| 资金来源: | 德州癌症预防与研究所乐动体育LDsports中国 |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 使用新的测序技术表征癌症基因组不稳定性和平移影响 |
| 资金来源: | 德州癌症预防与研究所乐动体育LDsports中国 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 转移性乳腺癌和前列腺癌的组学和多维空间图谱(OMS图谱) |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 用空间单细胞基因组学研究肿瘤乳腺癌中肿瘤的启动和侵袭 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 用单细胞基因组学描述乳腺癌化疗耐药的进化和生态 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 人乳房母乳细胞阿特拉斯种子网络 |
| 资金来源: | 陈扎克伯格倡议 |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 转移性乳腺癌患者治疗性的空间 - OMIC分析 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 利用单细胞基因组学划定乳腺癌抗患者对患者的抗性的演变 |
| 资金来源: | 姐妹机构网络基金，UTMDACC |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 通过EGLN抑制转化肠道放射反应，从而改善不可切征胰腺癌的临床结果 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | AML / MDS登月计划 |
| 资金来源: | UTMDACC登月计划 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 前列腺癌月亮拍摄 |
| 资金来源: | UTMDACC登月计划 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 乳腺癌登月 |
| 资金来源: | UTMDACC登月计划 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 小细胞肺癌(SCLC)的肿瘤异质性和治疗耐药 |
| 资金来源: | 国防部 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 立即防止导管癌患者侵入性过度处理 - 精度 |
| 资金来源: | 英国癌症研究中乐动体育LDsports中国心 |
| 角色： | 共同调查员 |