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      • 海量数据
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      2011年秋季:数据泛滥

      海量数据

      生物信息学控制信息过载,为个性化癌症药物创建蓝图

      黎明的多尔西

      多亏了快速发展的技术和开创性乐动体育LDsports中国在美国,在过去的几年里,人们对构成人体的分子的认识取得了快速而激烈的进展。

      但这种现象的另一面是,它产生数据的速度如此之快,以至于研究人员正在寻求技术来帮助他们优化结果。乐动体育LDsports中国

      随着发现的不断涌现,科学家们正在努力寻找方法来审查数据,并将其带入“现实世界”,以帮助预测、预防和治疗疾病。安德森的生物信息学与计算生物学系正处于学习翻译和使用这些信息的前沿,从而更接近于癌症的个性化治疗方法。

      “有些人认为人类基因组测序本身就是目的,”他说约翰·温斯坦,医学博士,博士,系教授兼系主任。“这是。但这仅仅是个开始。关于人体基因、蛋白质和其他分子的数据呈爆炸式增长。在医学史上,我们在实验室生成生物信息的速度第一次超过了在计算机上分析或解释信息的速度。”

      在数据的宇宙中遨游

      被称为生物信息学的科学学科使用定制的统计方法和超级计算机来缓解快速升级的发现造成的瓶颈。尖端的技术和技术使训练有素的专家能够从基因数据中筛选如何设计的信息癌症预防,诊断和治疗方案基于每个人独特的分子组成。这个科学领域建立在四大专业知识的基础上:生物学、统计学、临床医学和计算机科学。

      “MD安德森生物信息学的底线是学习如何个性化癌症药物,”温斯坦说。“如果我们能生成癌症的分子图谱,我们就能更好地为每个患者选择正确的治疗方法,更好的是,从一开始就能预防癌症的发展。”

      温斯坦描绘了一幅惊人的视觉画面,展示了人类生物学中令人难以置信的可能性和数量惊人的分子成分。

      他说:“把DNA从一端延伸到另一端,一个人体内的DNA可以绕赤道45万5千次,相当于绕太阳60圈。”“一个错误——突变——在这个长度中任何一个不幸的点都可能导致癌症。我们面临的挑战是了解突变和其他基因组畸变是如何发生的,这样我们就可以尝试预防它们,如果我们做不到,就知道该怎么做。”

      领导、合作、发现

      作为个体化癌症治疗分子图谱的先驱者之一,韦恩斯坦在癌症研究方面有自己的利害关系。乐动体育LDsports中国他的母亲、祖母和一些亲密的朋友都死于这种疾病。2008年,MD安德森从美国国家癌症研究所(National Cancer Institute)聘请了这位知名学者、研究员和发明家,他在那里工作了30多年。他的260篇论文中有11篇是以第一作者的身份发表在权威杂志《科学》上。

      自温斯坦上任以来,该部门迅速做出了回应
      MD安德森公司不断扩大的需求。在过去的两年里,它已经成功地从全国各地的顶尖机构招募了8名年轻的明星教师,以及20多名分析师、计算机科学家和研究员,以支持整个机构的研究。乐动体育LDsports中国

      2009-2010年,这些分析师为MD Anderson 40多个部门的150多名首席研究员的400多个研究项目提供了生物信息学支持。乐动体育LDsports中国2009年,该团队从联邦政府资助的癌症基因组图谱(Cancer Genome Atlas)那里获得了一笔为期五年、价值830万美元的拨款。

      私人慈善事业在支持该机构的生物信息学和计算生物学方面发挥着重要作用,从而有助于更好地了解癌症和控制癌症的能力。H.A.和Mary K. Chapman慈善基金会是为纪念俄克拉荷马州塔尔萨的慈善家Mary和Allen Chapman而建立的两个慈善实体。在韦恩斯坦的指导下,他慷慨地捐赠了175万美元,支持查普曼基金在个性化癌症治疗中的生物信息学。

      生物信息学项目还收到了一笔25万美元的匿名捐款,以及许多小额捐款。最近,迈克尔·戴尔和苏珊·戴尔基金会(Michael & Susan Dell Foundation)承诺拨款250万美元,以纪念迈克尔·戴尔的母亲、马里兰州安德森公司(MD Anderson)访客委员会成员、休斯顿的洛林·戴尔(Lorraine Dell)。洛林戴尔癌症个人化生物信息学项目将建立一个设备齐全的多学科团队,致力于分析和解释分子谱。

      除了计算机和实验室之外,该部门的统计分析师还与MD安德森的许多领域的临床和基础科学研究人员密切合作。乐动体育LDsports中国他们与生物医学科学家和临床医生并肩工作,以确定高效和有效的方法来探索每天产生的新数据。分析师提供宝贵的专业知识,帮助同事提交拨款和数据分析,回答研究人员的问题,并在每周的门诊探访中讨论问题。乐动体育LDsports中国

      充满潜力的未来

      今后,该部门将继续研究设计和使用计算机技术解释研究的新方法。乐动体育LDsports中国通过在MD安德森和更广泛的研究团体中建立合作关系,部门的科学家将扩大他们的知识,并学会识别在检查数据洪流时要问的重要问题。乐动体育LDsports中国而且,他们将继续通过与研究生、生物信息学学员、生物医学科学家和临床医生分享知识来发展他们的专业知识。

      温斯坦看到了令人兴奋的潜力,MD安德森学会利用该机构的巨大研究水平,朝着消除癌症的方向迈出了巨大的步伐。乐动体育LDsports中国

      他说:“拥有世界上最大、最具活力和最受尊敬的临床癌症研究项目,MD安德森拥有得天独厚的优势,能够抓住这一机遇,在个性化癌症治疗方面取乐动体育LDsports中国得重大进展。”“我们的研乐动体育LDsports中国究为治疗癌症提供了一个引擎,这是世界上任何地方都无法比拟的。”

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          约翰·温斯坦,医学博士,博士

          生物信息学和计算生物学教授

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