来自乳腺癌和妇科癌症研究的发现可能具有未来临床应用的潜力

对近2600例妇科和乳腺肿瘤的泛癌分析显示,在其他发现中,有5种以前未知的亚型

乐动体育LDsports中国研究人员德克萨斯大学安德森癌症中心通过对2579例乳腺癌和四种不同类型的妇科癌症的全面分析,我们发现了数量惊人的关于肿瘤分子特征的新信息,并确定了以前未知的癌症亚型。这些新发现可能成为未来治疗性研究的跳板。

这是由多机构共同努力的结果Rehan Akbani博士。副教授生物信息学与计算生物学刊登在本周出版的癌细胞

该研究是由癌症基因组阿特拉斯(TCGA),国家癌症研究所(NCI)和全国人类的共同努力,旨在通过检查通过癌症基因组(TCGA)可用的全套肿瘤来回癌症的大肿瘤的一部分。基因组研究所(乐动体育LDsports中国NHGRI)。本研究是若干综合性地图集和TCGA任务的若干若干癌症类型中的术语,并提供了加速我们对癌症的分子基础的社区资源。

Akbani说:“我们的目标是确定共同和独特的分子特征、临床重要亚型和潜在的治疗靶点。”“我们确认了之前在五种乳腺和妇科肿瘤类型中发现的相似之处,并发现了此前对这些疾病的研究中没有发现的有趣的分子关系。许多观察结果可能具有预后和/或治疗相关性,尽管这项研究揭示的任何临床可能性都需要广泛的额外研究,才能准备好在实际应用中。”乐动体育LDsports中国

该研究的关键结果包括:

  • 利用16个关键分子特征,该团队确定了5个预后癌症亚型,并开发了一个决策“树”,根据临床实验室可评估的6个特征将患者分类为亚型。
  • 鉴定具有高白细胞计数的其他亚型,提高未来免疫疗法治疗的潜在影响。
  • 发现基因和LNCRNA之间存在显着雌激素受体调节的长非编码RNA(LNCRNA)和相互作用“网络”。
  • 观察到许多遗传畸变,包括61个体细胞拷贝数改变(scna)和46个显著突变基因(SMGs)。在之前的五种肿瘤类型TCGA研究中,有11种scna和smg未被识别。

阿克巴尼说:“这项研究提供了一个基础广泛、经过精心策划的妇科和乳腺癌分子特征图谱,我们相信,在未来许多年里,它将成为该领域研究人员的一个起点。”乐动体育LDsports中国

约翰·温斯坦,医学博士,生物信息学和计算生物学主席,研究小组成员补充说:“这项研究补充了TCGA的其他综合泛癌症图谱项目,这些项目已经绘制了33种癌症类型的约11000例患者肿瘤的分子画像。”乐动体育LDsports中国

MD Anderson学习参与者包括Anil Korkut,Ph.D;Rupa Kanchi,博士;apurva hegde;Walter Lenoir;文本刘,博士;岳新刘,博士。Visweswaran Ravikumar;arvindrao,博士;和博士,博士。徐斌李; Keith Baggerly, Ph.D.; and John Weinstein, M.D., Ph.D., all of the Department of Bioinformatics & Computational Biology; Anil Sood, M.D., Gynecologic Oncology and Reproductive Medicine; Alexander Lazar, M.D., Ph.D., Pathology; Jason Roszik, Ph.D.,; Genomic Medicine; and Gordon Mills, M.D., Ph.D., and Christopher Vellano, Ph.D., Systems Biology.

其他参与机构包括广泛的研究所,剑桥,质量;van Andel 乐动体育LDsports中国Research Institute,Mich·雷达州大急流;休斯顿贝勒医学院;皇家理工学院,瑞典索尔纳;比利时根特大学;休斯顿大学;加利福尼亚州诺瓦托老龄化研究所;乐动体育LDsports中国加州大学旧金山;迈克尔史密斯基因组科学中心,温哥华,B.C;巴西圣保罗大学; Mayo Clinic College of Medicine, Rochester, Minn.; Dana Farber Cancer Institute, Boston; The University of Kansas Medical Center, Kansas City; University of Washington, Seattle; Medical College of Wisconsin, Milwaukee; University of Oklahoma Health Sciences Center, Oklahoma City; University of Alabama, Birmingham; University of Maryland School of Medicine, Baltimore; Institute of Human Virology, Abuja, Nigeria; Chang Gung University, Taoyun, Taiwan; Wake Forest Baptist Health Center, Winston-Salem, N.C.; University of New South Wales, Sydney; Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles; Leukemia Therapeutics, LLC, Hull, Mass,; National Cancer Institute, Bethesda, Md.; and New York University Langone Health, New York.

该研究由美国国家癌症研究所资助(U54 HG003273, U54 HG003067, U54 HG003079, U24 CA143799, U24 CA143835, U24 CA143840, U24 CA143843, U24 CA143845, U24 CA143848, U24 CA143858, U24 143866, U24 CA143867, U24 CA143882, U24 CA143883, U24 CA144025, U24 CA210949, U24 CA210950, P30 CA016672, P50 CA136393)。