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      马克·贝德福德博士

      基础科学学部表观遗传学和分子癌变学系

      关于贝德福德博士

      贝德福德博士的实验室专注于两个研究课题:乐动体育LDsports中国1)阐明精氨酸甲基化的生物学作用——一种涉及信号转导、转录控制和DNA修复的丰富修饰,2)开发一个蛋白结构域芯片平台,以研究转译后修饰在驱动信号转导中的蛋白-蛋白相互作用中的作用。他们已经针对这些精氨酸甲基转移酶建立了靶向破坏和功能获得小鼠模型,主要集中在CARM1上。利用他们的蛋白质结构域微阵列平台,他们已经识别和表征了新的蛋白质相互作用;他们使用这些阵列来“读取”组蛋白密码。他们已经确定了一些与赖氨酸和精氨酸甲基化基元相互作用的新蛋白质,以及可以与这些相互作用竞争的小分子。最近,Bedford实验室扩展了他们的阵列平台,包括所有的人类磷酸化阅读器结构域,乙酰基阅读器结构域,以及大部分人类PDZ结构域和泛素结合结构域。

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      目前职务及所属单位

      主要的约会

      德克萨斯大学安德森癌症中心表观遗传学和分子癌变学系教授

      乐动体育LDsports中国研究兴趣

      贝德福德实验室研究表观遗传学和癌症之间的交集,特别关注一类表观遗传标记——精氨酸甲基化。为了更好地理解精氨酸甲基化的生物学作用,他们的研究小组使用了许多不同的生物学方法来研究PRMT的功能。乐动体育LDsports中国这些包括小鼠PRMT功能获得和丧失模型,甲基结合蛋白的蛋白质微阵列筛选,PRMT底物的生化筛选,以及PRMT家族成员的化学抑制剂筛选。他们已经对小鼠中的许多精氨酸甲基转移酶基因进行了靶向破坏,希望揭示这种翻译后修饰的细胞和组织特异性作用。目前他们手上有CARM1、PRMT3和PRMT6的空鼠。他们正在对这些空白小鼠进行转录组分析(RNA-seq)和ChIP-seq,以识别它们调控的基因库。贝德福德小组也在进行双重敲除,以研究不同PRMTs之间的冗余。他们还在制造功能获得转基因小鼠模型,以确定体内PRMT过表达的影响。这些转基因小鼠可以通过与特定组织的cre系杂交而被激活。Cre表达移除lox/STOP/los盒并激活PRMT表达。 They have already generated PRMT6 gain-of-function mice using this approach. They are currently producing CARM1, PRMT1, PRMT5 and TDRD3 transgenic mice using the same approach.

      教育和培训

      授予教育

      1996 魏茨曼科学研究所,ISR,博士,发育生物学
      1989 Stellenbosch大学,ZAF,医学生物化学硕士
      1986 Stellenbosch大学,ZAF,学士,生物化学荣誉
      1985 Stellenbosch大学,ZAF,BS

      研究生培训

      1996-2000 博士后团契,哈佛医学院,波士顿,马

      选定的出版物

      同行评议的文章

      1. Avasarala S,Wu Py,Khan Sq,Yanlin S,Van Scoyk M,Bao J,Di Lorenzo A,David O,Bedford Mt,Gupta V,Winn Ra,Bikkavilli RK.PRMT6通过交替激活肿瘤相关巨噬细胞促进肺肿瘤进展。中国生物医学工程学报,2019,32(1):1 - 8。e-Pub 2019。
      2. Manickavinayaham S,Vélez-Cruz R,Biswas Ak,Bedford E,Klein Bj,Kutateladze Tg,Liu B,Bedford Mt,Johnson DG.E2F1乙酰化直接P300 / CBP介导的DNA双链突破的组酮乙酰化,以促进修复。NAT Commun 10(1):4951,2019。
      3. Bao J,Di Lorenzo A,Lin K,Lu Y,Zhong Y,Sebastian MM,Muller WJ,Yang Y,Bedford Mt.小鼠模型的过表达揭示了不同的I型蛋白精氨酸甲基转移酶的不同致癌作用。癌症研究(1):21-32,2019。e-Pub 2018。
      4. Wu X, Liu S, Sagum C, Chen J, Singh R, Chaturvedi A, Horton JR, Kashyap TR, Fushman D, Cheng X, Bedford MT, Wang B . Wu X, Liu S, Sagum C, Chen J, Singh R, Chaturvedi A, Horton JR, Kashyap TR, Fushman D, Cheng X, Bedford MT, Wang B.在DNA损伤部位的Lys63和Lys11-络合蛋白信号传导之间的串扰由Cezanne驱动。基因DEV 33(23-24):2019年1702-1717。E-PUB 2019。
      5. Hupalowska A,Jedrusik A,Zhu M,Bedford Mt,Glover DM,Zernicka-Goetz M.CARM1和ParaSpeckles规范预植入小鼠胚胎发育。Cell 175(7):1902-1916,2018。
      6. Cheng D, Vemulapalli V, Lu Y, Shen J, Aoyagi S, Fry CJ, Yang Y, Foulds CE, Stossi F, Trevino LS, Mancini MA, O'Malley BW, Walker CL, Boyer TG, Bedford MT.CARM1甲基化MED12调节其RNA结合能力。生活SCI联盟1(5):E201800117,20101817,2018。
      7. Han Z, Schwoerer MP, Hicks P, Liang J, Ruthel G, Berry CT, Freedman BD, Sagum CA, Bedford MT, Sidhu SS, Sudol M, Harty RN.宿主蛋白BAG3是拉沙VLP出口的负调控因子。疾病6(3):64、2018。
      8. Bae N, Viviano M, Su X, Lv J, Cheng D, Sagum C, Castellano S, Bai X, Johnson C, Khalil MI, Shen J, Chen K, Li H, Sbardella G, Bedford MT.利用蛋白质微阵列开发纺锤蛋白1小分子抑制剂。中国生物化学学报13(7):750-756,2017。e-Pub 2017。
      9. 高G,Dhar S,Bedford MT.PRMT5通过hnRNP A1的甲基化调控ires依赖的翻译。核酸研究进展(8):4359- 69,2017。e-Pub 2017。
      10. Shanle Ek,Shinsky SA,Bridgers JB,Bae N,Sagum C,Krajewski K,Rothbart SB,Bedford Mt *,Strahl BD *(*通讯作者).组蛋白多肽芯片筛选的chromo和Tudor域定义了新的组蛋白赖氨酸甲基化相互作用。《表观遗传学》2017年第10期。
      11. Espejo Ab,高G,Black K,Gayatri S,veland N,Kim J,Chen T,Sudol M,Walker C,Bedford Mt.PRMT5 c端磷酸化调节14-3-3/PDZ相互作用开关。中国生物化学(英文版),2017,33(6):646 - 648。
      12. 贾亚特里,考尔斯MW, Vemulapalli V,程东,孙忠伟,贝德福德MT.利用定向肽阵列文库评价精氨酸特异性抗体和精氨酸甲基转移酶底物基序。Sci代表6:28718,2016。
      13. Yang Y, hajikyriacou A, Xia Z, Gayatri S, Kim D, Zurita-Lopez C, Kelly R, Guo A, Li W, Clarke SG, Bedford MT.PRMT9是II型甲基转移酶,可将剪接因子SAP145甲基化。Nat Commun 6:6428, 2015。
      14. di lorenzo a,yang y,macaluso m,Bedford Mt.功能获得小鼠模型识别PRMT6为NF-kB共激活因子。中国生物医学工程学报,2014,33(3):457 - 461。
      15. 杨y,麦克布莱克,Hensley S,Lu Y,Chedin F,Bedford Mt.精氨酸甲基化有助于募集TOP3B至染色质,以防止R环积累。Mol Cell 53(3):484-97,2014。
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