Prahlad T. Ram，Ph.D.

同行评议的文章

1. Seviour EG, Sehgal V, Mishra D, Rupaimoole R, Rodriguez-Aguayo C, Lopez-Berestein G, Lee JS, Sood AK, Kim MP, Mills GB, Ram PT。通过临床显著的miR-193a-3p靶向kras依赖性肿瘤生长、循环肿瘤细胞和体内转移。致癌基因36(10):1339 - 1350年,2017年。e-Pub 2016。PMID: 27669434。
2. 杨L, Achreja Yeung TL, Mangala LS,江D,汉族C,巴多尔J,马里尼JC,倪J, Nakahara R, Wahlig年代,千叶L,金正日SH,莫尔斯J, Pradeep年代,Nagaraja, Haemmerle M,庆熙N, Derichsweiler M, Plackemeier T, Mercado-Uribe我Lopez-Berestein G,苔藓T, Ram PT,刘J,陆X, Mok SC, Sood AK, Nagrath D。肿瘤中基质谷氨酰胺合成酶的靶向破坏肿瘤微环境调节的癌细胞生长。中国生物医学工程学报，2016,35(5):643 - 648。PMID: 27829138。
3. Tetzlaff MT, Singh RR, Seviour EG, Curry JL, Hudgens CW, Bell D, Wimmer DA, Ning J, Czerniak BA, Zhang L, Davies MA, Prieto VG, Broaddus RR, Ram P, Luthra R, Esmaeli B . Tetzlaff MT, Singh RR, Seviour EG, Curry JL, Hudgens CW, Bell D, Wimmer DA, Ning J, Czerniak BA, Zhang L, Davies MA, Prieto VG, Broaddus RR, Ram P, Luthra R, Esmaeli B。下一代测序发现皮脂腺癌中具有临床活性的基因的高频率突变。中国病理杂志(1):84- 95,2016。PMID: 27287813。
4. Chaluvally-Raghavan P, Jeong KJ, Pradeep S, Silva AM, Yu S, Liu W, Moss T, Rodriguez-Aguayo C, Zhang D, Ram P, Liu J, Lu Y, Lopez-Berestein G, Calin GA, Sood AK, Mills GB. MicroRNA-551b-3p直接上调STAT3可解除对卵巢癌生长和转移的调控。细胞代表15（7）：1493-5042016。2016年电子酒吧。PMID:27160903。
5. 吴SY, Rupaimoole R,沈F, Pradeep年代,Pecot简历,伊凡C, Nagaraja, Gharpure公里,范教授E,畠山直哉H, McGuire MH, Haemmerle M, Vidal-Anaya V,奥尔森C, Rodriguez-Aguayo C, Filant J, Ehsanipour EA Herbrich SM, Maiti SN,黄L, Kim JH张X,韩寒高清,Armaiz-Pena GN, Seviour如塔克年代,张M,杨D,库珀LJ, Ali-Fehmi R, Bar-Eli M,Lee JS, Ram PT, Baggerly KA, Lopez-Berestein G, Hung MC, Sood AK。miR-192-EGR1-HOXB9调控网络控制癌症中的血管生成开关。Nat Commun 7:11169, 2016。e-Pub 2016。PMID: 27041221。
6. Kang Y、Nagaraja AS、Armaiz Pena GN、Dorniak PL、Hu W、Rupaimoole R、Liu T、Gharpure KM、Previs RA、Hansen JM、Rodriguez Aguayo C、Ivan C、Ram P、Sehgal V、Lopez Berestein G、Lutgendorf SK、Cole SW、Sood AK。肾上腺素能刺激Dusp1损害卵巢癌中的化疗反应。Clin Cancer Res 22（7）：1713-24,2016。E-PUB 2015. PMID：26581245。
7. Seviour EG, Sehgal V, Lu Y, Luo Z, Moss T, Zhang F, Hill SM, Liu W, Maiti SN, Cooper L, Azencot R, Lopez-Berestein G, Rodriguez-Aguayo C, Roopaimoole R, Pecot CV, Pecot C, Sood AK, Mukherjee S, Gray JW, Mills GB, Ram PT。功能蛋白质组学鉴定miRNAs靶向p27/Myc/phospho-Rb标记在乳腺癌和卵巢癌中。致癌基因35(6):691 - 701年,2016年。e-Pub 2015。PMID: 25639871。
8. Zhao H, Yang L, badour J, Achreja A, Bernard V, Moss T, Marini JC, Tudawe T, Seviour EG, San Lucas FA, Alvarez H, Gupta S, Maiti SN, Cooper L, Peehl D, Ram PT, Maitra A, Nagrath D。肿瘤微环境来源的外泌体多效调节癌细胞代谢。Elife 5: e10250, 2016年。e-Pub 2016。PMID: 26920219。
9. Chiu HS, llobett - navas D, Yang X, Chung WJ, Ambesi-Impiombato A, Iyer A, Kim HR, Seviour EG, Luo Z, Sehgal V, Moss T, Lu Y, Ram P, Silva J, Mills GB, Califano A, Sumazin P。丘比特:同时重建microrna靶点和ceRNA网络。中国生物医学工程学报，2015,35(2):457 - 461。PMID: 25378249。
10. 张Chaluvally-Raghavan P, F, Pradeep年代,汉密尔顿MP,赵X, Rupaimoole R,苔藓T,陆Y, Yu年代,Pecot简历,Aure先生,Peuget年代,Rodriguez-Aguayo C,韩寒高清,张D, Venkatanarayan, Krohn M, Kristensen VN, Gagea M Ram P,刘W, Lopez-Berestein G, Lorenzi PL, Børresen-Dale,下巴K,灰色J, Dusetti新泽西,McGuire,弗洛雷斯,Sood AK,米尔斯GB。hsa-miR-569在3q26.2位点的拷贝数增加导致TP53INP1的缺失和上皮癌的侵袭性。中国生物医学工程学报，2019,32(6):863- 869,2014。PMID: 25490449。
11. PRADEEP S，KIM SW，WU SY，Nishimura M，Chaluvally-Raghavan P，Miyake T，Pecot CV，Kim Sj，Choi Hj，Bischoff Fz，Mayer Ja，Huang L，尼克上午，Hall CS，Rodriguez-Aguayo C，ZandB，Dalton Hj，Arumugam T，Lee Hj，Han HD，Cho Ms，Rupaimoole R，Mangala Ls，Sehgal v，Sehgal v，oh sc，liu J，Lee Js，Coleman Rl，Ram P，Lopez-Berestein G，Lipler IJ，SoodAK.。卵巢癌血行转移:对转移方式的反思。中国生物医学工程学报，2017,32(1):97 - 101。PMID: 25026212。
12. 胡W，刘T，伊凡C，孙Y，黄J，曼加拉LS，三宅院T，道尔顿HJ，普拉迪普S，鲁帕穆勒R，普雷维斯RA，韩HD，博茨福德米勒J，赞德B，康Y，佩科CV，尼克AM，吴SY，李JS，塞加尔V，拉姆P，刘J，塔克SL，洛佩斯贝雷斯坦G，巴格利卡，科尔曼RL，苏德阿克. 卵巢癌中Notch3通路的改变。《癌症研究》74（12）：3282-932014。PMID:24743243。
13. Werner HM, Mills GB, Ram PT。癌症系统生物学:窥视病人护理的未来?。中国科学(d辑):地球科学(d辑)，2014。PMID: 24492837。
14. Matsuo K, Nishimura M, Komurov K, Shahzad MM, Ali-Fehmi R, Roh JW, Lu C, Cody DD, Ram PT, Loizos N, Coleman RL, Sood AK。血小板衍生的生长因子受体α（PDGFRα）卵巢癌中的靶向和相关生物标志物。Gynecol Oncol 132（1）：166-75,2014。PMID：24183729。
15. Nishikawa T, Bellance N, Damm A, Bing H, Zhu Z, Handa K, Yovchev MI, Sehgal V, Moss TJ, Oertel M, Ram P, Pipinos II, Soto-Gutierrez A, Fox IJ, Nagrath D。ATP生产来源的开关和进行糖酵解的能力损失是预先肝病的肝细胞失效的标志。J Hepatol，2014. PMID：24583248。
16. 卢武铉、黄杰、胡伟、杨X、詹宁斯、新罕布什尔州、塞加尔五世、Sohn BH、韩HD、李SJ、塔纳帕帕D、博特福德·米勒J、赞德B、道尔顿HJ、普雷维斯·拉、戴维斯·安、马佐克、李JS、拉姆·PT、科尔曼·R、苏德·阿克。血小板衍生生长因子受体α阻断在子宫癌的生物学作用。Clin Cancer Res，2014. PMID：24634380。
17. adevaia S, Nakhleh LK, Azencott R, Ram PT。综合信号电路设计中映射网络元件的可调谐性和鲁棒性。PLoS One 9(3): e91743,2014。PMID: 24642504。
18. Akbani R, Ng PK, Werner嗯,Shahmoradgoli M,张F, Ju Z,刘W,杨司法院,俊井K,李J,凌年代,Seviour如Ram PT,明娜JD,刁L,通P, Heymach合资,希尔SM, Dondelinger F,施N,拜尔斯洛杉矶,Meric-Bernstam F,温斯坦约,扫帚BM, Verhaak RG,梁H,慕克吉年代,陆Y,米尔斯GB. 癌症基因组图谱的泛癌症蛋白质组学观点。Nat Common 5:38872014。PMID:24871328。
19. 杨L，Moss T，Mangala LS，Marini J，Zhao H，Wahlig S，Armaiz-Pena G，Jiang D，Achreja A，Win J，Roopaimoole R，Rodriguez-Aguayo C，Mercado-Uribe I，Lopez-Berestein G，刘j，tsukamoto t，sood ak，ram pt，nagrath d。对谷氨酰胺的代谢变化调节卵巢癌中的肿瘤生长，侵袭和生物终体学。MOL SYST BIOL 10：728,2014。PMID：24799285。
20. Sehgal v，ram pt。JNK信令中的网络主题。中国生物医学工程学报，2013,29(4):513 - 514。PMID: 24349639。
21. Slingluff CL、Petroni GR、Molhoek KR、Brautigan DL、中国公牛队KA、Shada AL、Smolkin ME、Olson WC、Gaucher A、Chase CM、Grosh WW、Weiss GR、Wagenseller AG、Olszanski AJ、Martin L、Shea SM、Erdag、Ram P、Gershenwald JE、Weber MJ. 替西莫司和贝伐单抗联合治疗晚期黑色素瘤的临床活性和安全性：II期试验（CTEP 7190/Mel47）。《临床癌症研究》19（13）：3611-202013。PMID:23620404。
22. Pecot简介，卢比大声r，杨d，akbani r，ivan c，lu c，吴s，汉高清，shah我，rodriguez-aguayo c，bottsford-miller j，liu y，金sb，unsuh a，gonzalez-villasana v，黄l，Zand B，莫伦诺 - 史密斯M，Mangala Ls，Taylor M，Dalton Hj，Sehgal V，Wen Y，kang Y，Baggerly Ka，Lee Js，Ram Pt，Ravoori Mk，Kundra V，Zhang x，Ali-Fehmi R，Gonzalez-Angulo Am，Cashion PP，Calin Ga，Lopez-Berestein G，张W，Sood Ak。miR-200家族对肿瘤血管生成的调控。Nat Commun 4:2427, 2013。PMID: 24018975。
23. Ram PT, Mendelsohn J, Mills GB。生物信息学和系统生物学。中国海洋大学学报(自然科学版)，2012。PMID: 22377422。
24. Komurov K, Dursun S, Erdin S, Ram PT. NetWalker：功能基因组学的上下文网络分析工具。BMC基因组学13（1）：28220012。采购经理人指数：22732065。
25. Komurov K, Tseng JT, Muller M, Seviour EG, Moss TJ, Yang L, Nagrath D, Ram PT。葡萄糖剥夺反应网络抵消了拉帕替尼耐药细胞中的EGFR信号。中国生物科学(英文版):2012。PMID: 22864381。
26. Matsuo K, Nishimura M, Bottsford-Miller JN, Huang J, Komurov K, Armaiz-Pena GN, Shahzad MM, Stone RL, Roh JW, Sanguino AM, Lu C, Im DD, Rosenshien NB, Sakakibara A, Nagano T, Yamasaki M, Enomoto T, Kimura T, Ram PT, Schmeler KM, Gallick GE, Wong KK, Frumovitz M, Sood AK。Src在黏液性卵巢癌中的靶向作用。中国临床肿瘤杂志，17(6):597 - 598,2011。PMID: 21737505。
27. Lu Y, Muller M, Smith D, Dutta B, komurrov K, Iadevaia S, Ruths D, Tseng JT, Yu S, Yu Q, Nakhleh L, Balazsi G, Donnelly J, Schurdak M, Morgan-Lappe S, Fesik S, Ram PT, Mills GB. Kinome-siRNA磷酸蛋白质组筛选识别调节AKT信号的网络。癌基因，2011年。PMID:2166717。
28. Nick AM, Stone RL, Armaiz-Pena G, Ozpolat B, Tekedereli I, Graybill WS, Landen CN, Villares G, Vivas-Mejia P, Bottsford-Miller J, Kim HS, Lee JS, Kim SM, Baggerly KA, Ram PT, Deavers MT, Coleman RL, Lopez-Berestein G, Sood AK。卵巢癌中p130Cas的沉默:肿瘤细胞死亡的新机制中国癌症杂志，2011。PMID: 21957230。
29. Gopal YN, Deng W, Woodman SE, Komurov K, Ram P, Smith PD, Davies MA。在braf突变的人类皮肤黑色素瘤细胞中，基础和治疗诱导的AKT激活介导了AZD6244 (ary -142886)对细胞死亡的抵抗。中国生物医学工程学报，2010,29(3):457 - 461。PMID: 20959481。
30. Iadevaia S、Lu Y、Morales FC、Mills GB、Ram PT。识别靶向细胞网络的最佳药物组合:整合磷蛋白组学和计算网络分析。中国生物医学工程学报，2017,29(4):457 - 461。PMID: 20643779。
31. Taube JH，Herschkowitz Ji，Komurov K，Zhou Ay，Gupta S，Yang J，Hartwell K，Onder TT，Gupta PB，Evans KW，Hollier BG，Ram Pt，Lander Es，Rosen JM，Weinberg Ra，Mani SA。核心上皮-间充质转化相互作用组基因表达特征与claudin-low和化生乳腺癌亚型相关。中国科学(d辑):地球科学(英文版)，2010。PMID: 20713713。
32. 科穆罗夫K，白马，公羊角。在图上使用数据偏置随机游走从基因组数据中检索上下文特定网络。公共科学图书馆，2010。PMID: 20808879。
33. Komurov K, Ram PT。人类基因表达变异的模式与信号网络等级关系密切。BMC Syst Biol 4(1):154, 2010。PMID: 21073694。
34. ruth D, Nakhleh L, Ram PT。利用PathwayOracle快速探索信令网络的结构和动态特性。BMC Syst Biol 2(1): 76,2008。PMID: 18713463。
35. Muller M, obieesekere M, Mills GB, Ram PT。网络拓扑结构决定了哺乳动物MAPK1,2信号网络的动态:FGFR和MC1R对C-Raf和B-Raf亚型的bifan motif调控。中国科学(d辑):地球科学(英文版)，2008。PMID: 18171696。
36. 罗思，马勒，曾志强，纳克勒，拉姆. 基于信号petri网的模拟器：一种描述细胞特定信号网络动态特性的非参数策略。PLoS计算机生物学4（2）：E10000052008。PMID:18463702。
37. Aaronson DS, Muller M, Neves SR, Chung WC, Jayaram G, Iyengar R, Ram PT。雄激素- il -6- stat3自分泌环路在前列腺癌细胞中重定向EGF信号。中国生物医学工程学报2(1):1- 4,2007。PMID: 17374439。
38. Ruths D，Tseng J-T，Nakhleh L，Ram Pt。基于蛋白相互作用、靶向治疗和蛋白芯片分析的DeNovo信号通路预测。信号4532:108 - 118,2007。
39. Ruths DA, Nakhleh L, Iyengar MS, Reddy SA, Ram PT。信号网络中的假设生成。中国生物医学工程学报13(9):1546- 57,2006。PMID: 17147477。
40. 他JC，GOMES I，Nguyen T，Jayaram G，Ram Pt，Devi La，Iyengar R。G α (o/i)偶联大麻素受体介导的神经突生长涉及Src和Stat3的Rap调控。中国生物医学工程学报29(4):417 - 418,2005。PMID: 16046413。
41. 马亚安A、詹金斯SL、内维斯S、哈塞尔丁A、格雷斯E、杜宾泰勒B、恩格丹荣NJ、翁G、拉姆PT、赖斯JJ、克申鲍姆A、斯托洛维茨基GA、布利泽路、艾扬格R. 哺乳动物细胞网络中信号传播过程中调节模式的形成。《科学》309（5737）：1078-832005。PMID:16099987。
42. Campagne F, Neves S, Chang CW, Skrabanek L, Ram PT, Iyengar R, Weinstein H。细胞网络生化计算的定量信息管理。通信学报，2004,33(4):514 - 514。PMID: 15340175。
43. Bhalla US, Ram PT, Iyengar R。将激酶磷酸酶作为丝裂型蛋白激酶信号网络中的柔韧性的轨迹。科学297（5583）：1018-23,2002。PMID：12169734。
44. Ram PT，Dai J，袁L，董C，基弗TL，赖L，希尔SM. 人类乳腺癌中mt1褪黑素受体的参与。《癌症》179（2）：141-502002。PMID:11888668。
45. 基弗T，拉姆PT，袁L，希尔SM。褪黑素抑制乳腺癌细胞中雌激素受体的反式激活和cAMP水平。乳腺癌治疗71(1):37-45,2002。PMID: 11859872。
46. Obrink B, Sawa H, Scheffrahn I, Singer BB, Sigmundsson K, Sundberg U, Heymann R, Beauchemin N, Weng G, Ram P, Iyengar R . Obrink B, Sawa H, Scheffrahn I, Singer BB, Sigmundsson K, Sundberg U, Heymann R, Beauchemin N, Weng G, Ram P, Iyengar R。PC12细胞中CEACAM1-A细胞粘附分子对亚型特异性信号调控的计算分析中国科学(d辑:地球科学)，2002。PMID: 12438192。
47. 戴J，Ram Pt，Yuan L，Spriggs Ll，Hill Sm。褪黑素对人乳腺癌细胞RORalpha活性的转录抑制。中国生物医学工程学报，2017,32(2):417 - 421。PMID: 11369450。
48. 王志强，王志强，王志强，王志强. MCF-7人乳腺癌细胞株对松果体激素褪黑素的不同反应性。松果体研究杂志28（4）：210-820000。PMID:10831156。
49. Ram PT, Horvath CM, Iyengar R. Stat3通过组成性活性Q205L Galphao蛋白介导NIH-3T3细胞的转化。《科学》287（5450）：142-42000。采购经理人指数：10615050。
50. Eck KM、Yuan L、Duffy L、Ram PT、Ayettey S、Chen I、Cohn CS、Reed JC、Hill SM。用褪黑素和全反式维甲酸的序贯治疗方案诱导MCF-7肿瘤细胞凋亡。中华结核和呼吸杂志，2003,22(3):417 - 418。PMID: 9649124。
51. Ram PT, Kiefer T, Silverman M, Song Y, Brown GM, Hill SM。褪黑素和生长因子在MCF-7乳腺癌细胞中的雌激素受体转激活作用。中国生物医学工程学报，2000,22(1):53- 56。PMID: 9723886。
52. 陈俊，Bander JA, Santore TA, Chen Y, Ram PT, Smit MJ, Iyengar R。Q227L-Galphas在MCF-7人乳腺癌细胞中的表达抑制了肿瘤发生。Proc Natl Acad SCI U S A 95（5）：2648-52,1998. PMID：9482941。
53. Worrad DM, Ram PT, Schultz RM。小鼠卵母细胞和早期预体胚胎基因表达的调节：SP1和塔塔盒结合蛋白，TBP的发育变化。发展120（8）：2347-57，1994. PMID：7925035。
54. Temeles GL, Ram PT, Rothstein JL, Schultz RM。小鼠着床前胚胎发生中新基因的表达模式。中国科学(d辑):地球科学(d辑)，1994。PMID: 7545925。
55. Ram PT, Schultz RM。小鼠1细胞胚胎G2报告基因表达。中国科学(d辑):地球科学(d辑)，1993。PMID: 8462750。
56. 吴年代,杨X, Gharpure公里,畠山直哉H,艾格力M, McGuire M, Nagaraja,宅一生T, Rupaimoole R, Pecot C,泰勒M, Pradeep年代,Sierant M, Rodriguez-Aguayo C,崔H, Previs R, Armaiz-Pena GN,黄L,马丁内斯C, Hassell设计T,伊凡C, Sehgal V, Singhania R,韩寒H-D,苏C, Kim陶宏根道尔顿H, Kowali C, Keyomarsi K,麦克米兰N, Overwijk W,刘J,Lee J-S, Baggerly K, Lopez-Berestein G, Ram PT, NawrotB, Sood A。利用新型2'- ome -磷酸二硫代修饰的sirna在癌症中引发有效的RNAi应答。Nat Commun: 12; 5:3459。PMID: 24619206。

邀请的文章

1. 轩尼诗英国电信公司、史密斯律师事务所、拉姆律师事务所、吕律师事务所、米尔斯律师事务所。利用PI3K/AKT通路开发抗癌药物。中国新药杂志4(12):988- 1004,2005。PMID: 16341064。
2. Neves SR，Ram Pt，Iyengar R。Hetrotrimeric G蛋白途径。科学296（5573）：2002年1636-9.PMID：12040175。
3. Ram Pt，Iyengar R。G蛋白偶联受体通过Src和Stat3通路:在增殖和转化中的作用。致癌基因20(13):1601 - 2001。PMID: 11313907。
4. Hill SM, Teplitzky S, Ram PT, Kiefer T, Blask DE, Spriggs LL, Eck KM。褪黑素与维甲酸协同作用于乳腺癌的预防和消退。《Exp Med Biol》460:345- 62,1999年版。PMID: 10810532。

其他文章

1. Ram Pt，Iyengar RGas, Gaq, Ga12, Ga13信号网络的G蛋白连接图。科学表明,2002年。

书章

1. 马志强，陈志强。MAPK1 - 2网络的系统生物学特性。见于:系统生物学和信号网络。施普林格出版社:纽约，2010。
2. Ram PT，Jordan DJ，Iyengar R.Gao信号传导的效应器。In：手机信号手册。学术出版社，605-607，2004年。
3. Ram PT。紧密调控蛋白过表达:NIH 3T3细胞中蛋白磷酸酶2A过表达。见:方法酶法，551-5,2002。
4. 信号转导。见:麦格劳-希尔科学技术百科全书第9版。麦格劳-希尔,2002年。
5. Hill SM, Ram PT, Molis TM, Spriggs LL。肿瘤细胞水平的褪黑素。在:肿瘤和精神疾病中的褪黑素。美国精神病学协会出版社，华盛顿，191-242,1998。